（發(fā)改環(huán)資〔2016〕1162號），《指導意見》圍繞貫徹黨中央、國務院關于加快生態(tài)文明建設、健全生態(tài)文明制度體系的決策部署，立足指導紅線劃定工作，推動建立紅線管控制度，明確了加強紅線管控的總體要求、基本原則、管控內(nèi)涵、指標設置、管控制度和組織實施。
《指導意見》指出，統(tǒng)籌考慮資源稟賦、環(huán)境容量、生態(tài)狀況等基本國情，根據(jù)我國發(fā)展的階段性特征及全面建成小康社會目標的需要，合理設置紅線管控指標，構(gòu)建紅線管控體系，健全紅線管控制度，構(gòu)建人與自然和諧發(fā)展的現(xiàn)代化建設新格局。
《指導意見》提出了紅線管控的內(nèi)涵及主要指標設置，要通過劃定并嚴守資源消耗上限、環(huán)境質(zhì)量底線、生態(tài)保護紅線，強化資源環(huán)境生態(tài)紅線指標約束，將各類經(jīng)濟社會活動限定在紅線管控范圍以內(nèi)。設定資源消耗上限，合理設定全國及各地區(qū)資源消耗“天花板”，對能源、水、土地等戰(zhàn)略性資源消耗總量實施管控，強化資源消耗總量管控與消耗強度管理的協(xié)同；嚴守環(huán)境質(zhì)量底線，以改善環(huán)境質(zhì)量為核心，以保障人民群眾身體健康為根本，與地方限期達標規(guī)劃充分銜接，分階段、分區(qū)域設置大氣、水和土壤環(huán)境質(zhì)量目標；劃定生態(tài)保護紅線，根據(jù)涵養(yǎng)水源、保持水土、防風固沙、調(diào)蓄洪水、保護生物多樣性，以及保持自然本底、保障生態(tài)系統(tǒng)完整和穩(wěn)定性等要求，在重點生態(tài)功能區(qū)、生態(tài)環(huán)境敏感區(qū)和脆弱區(qū)等區(qū)域，以及森林、草原、濕地、海洋等領域劃定生態(tài)保護紅線，嚴格自然生態(tài)空間征（占）用管理，有效遏制生態(tài)系統(tǒng)退化的趨勢。
《指導意見》要求，從建立紅線管控目標確定及分解落實機制、完善與紅線管控相適應的準入制度、加強資源環(huán)境生態(tài)紅線實施監(jiān)管、加強統(tǒng)計監(jiān)測能力建設、建立資源環(huán)境承載能力監(jiān)測預警機制、建立紅線管控責任制等6個方面，加快形成源頭嚴防、過程嚴管、責任追究的紅線管控制度體系，并對加強紅線管控組織領導、明確部門工作重點、鼓勵公眾參與等方面提出了明確要求。